一、研究院简介

上海中医药大学交叉科学研究院于2016年成立。研究院建立伊始就致力于中医药学与生命医学相关学科的交叉融合，旨在通过发挥多学科交叉和人才聚集优势，打造面向国际、国内一流的中医药多学科交叉和生物医学前沿的系列研究平台。研究院围绕国家重大需求和国际生命医学领域前沿问题，立足中医药现代化与国际化的关键难题，加强中医药自主创新与国际合作，促进中医药学与生命医学相关学科的交叉融合，加快中医药基础研究向临床研究的转化和应用，为我国日益增长的全民健康服务需求做出重要贡献。

研究院成立至今，先后从海内外引进了一批具有国际水准的高水平研究团队，并建立了一系列具有国际领先水平的技术平台，如组学分析、化学生物学、系统药理学、药代动力学、生物信息学等。相关科研团队在中医药系统生物学、中药系统药理学及精准用药、系统药代及新型递药系统、中医药大数据分析等领域开展了大量创新性研究工作。研究院目前承担国家重点研发计划中医药现代化专项、重大新药创制专项、国家自然科学基金、中国博士后科学基金等国家级科研课题40余项，省部级课题15项，横向合作课题20余项。

图1 上海中医药大学交叉科学研究院的组织构架

近两年来，交叉科学研究院共发表学术论文100余篇，其中SCI收录论文90余篇，含IF＞10.0的高水平论文8篇，IF＞5.0的高水平论文20余篇。部分科研成果发表在Science Translational Medicine、Nature Chemical Biology、Advanced Science、ACS Nano、American Journal of Psychiatry、Trends Biochem Sci、Trends Pharmacol Sci、Pharmacol Ther、Obesity Reviews、Biosensors&Bioelectronics、Oncogene、Journal of Medicinal Chemistry、Analytical Chemistry、Clin Pharmacokinet、Journal of Experimental and Clinical Cancer Research、EBioMedicine、Chemical Communications、Acta Pharmaceutica Sinica B 等国际著名学术刊物上。此外，还申报各类发明专利10余项；主编或参编专著8部。

目前研究院拥有开展中药化学、药物化学、药物动力学、系统生物学、分子药理学以及生物信息学研究所需的各类硬件设备，包括Q Exactive?HF-X组合型四极杆Orbitrap?质谱仪、超高分辨率活细胞成像系统、Operetta CLS高内涵细胞成像分析系统、高分辨飞行时间蛋白组液质联用仪（Triple-TOF 5600）、串联三重四极杆质谱联用仪（Triple-QUAD 4500）、微量热泳动仪、细胞能量代谢分析系统、多功能细胞定量分析仪、电感耦合等离子质谱仪、紫外引导自动纯化制备液相色谱系、超速离心机、倒置荧光显微镜、全自动荧光酶标仪、高效液相色谱仪等大型仪器。

二、主要研究领域

1.中医药系统生物学

中医药系统生物学研究中心在传统中医药理论指导下，开展以系统生物学技术为基础的中医病证系统诊疗和中药作用分子机制等研究。系统生物学从整体出发，用“组学”手段研究由人体和共生微生物等构成的“超级生物体”的生理病理现象，与中医药基于整体观的理念和方法论一致，是中医药学与西方医药学之间沟通的桥梁。研究中心以中医药的继承与创新为指导思想，以中医药现代化、国际化为己任，一方面利用基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、微生物组学等组学研究方法，采用“病-证-方”结合的体系思路，结合信息挖掘分析技术，进行中医整体观、治未病、辨证论治和方剂配伍等理论的生物学基础研究，建立临床适用的创新中医辨证论治方法体系，并研发如组分配伍中药复方等创新性中药新药；另一方面利用分子生物学基因操控等微观研究方法，采用化学生物学的研究思路，寻找中药中活性成分并阐明其活性的化学基础和分子机制，并以活性小分子为工具考察其对生物体的扰动（干扰/调节过程），解析生物体的生理和病理过程，以期发现新型的药物成药分子靶点，为解析中药多成分多靶点的作用机制和中药传统用途的拓展研发提供基础。

图2 中医药系统生物学研究概况示意图

2.中药系统药理及精准用药

中药系统药理学研究中心以系统生物医学和中医药学术思想为指导，瞄准国际前沿和国家重大战略需求，围绕肿瘤、神经退行性疾病等重大疾病治疗，发掘中药有效成分，阐明药物靶标和网络药理学调控机制，实现理论创新。建立药效学以及基因、蛋白、药物网络分析等技术整合，对中药进行多层次的系统研究，全面揭示中药多成分、多靶点、多通路的整体协同作用的特点，为中医基础理论研究如复方配伍、性味归经、病证关联等研究提供新的方法学，从系统水平和分子水平系统，深刻地揭示中药和机体的相互作用机制，指导中药新药开发。开展中医药精准医学研究，针对目前中药临床药学研究中存在的瓶颈问题，建立“药物系统-生物系统”互作模式，指导中药个体化精准用药。